Le MTQ est réparti en neuf sections, soit la :

• Section 1 – regroupe les ingénieurs oeuvrant dans deux Directions territoriales de l’EST du Québec soit ceux oeuvrant à Sept-Îles, Baie-Comeau, Cap-aux-Meules, Gaspé, New Carlisle, Rimouski, Saint-Pascal et Cacouna ;
• Section 2 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant pour la Direction territoriale de la Capitale nationale ou la Direction des laboratoires et chaussées ainsi que ceux travaillant pour le Centre de gestion de l’équipement roulant (CEGER) ;
• Section 3 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant au 700, boul. René-Lévesque à Québec;
• Section 4 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant au 930, chemin Sainte-Foy à Québec;
• Section 5 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant dans trois Directions territoriales de l’EST du Québec soit ceux oeuvrant à Roberval, Saguenay, Saint-Romuald, Charny, Beauceville, Trois-Rivières, Victoriaville et Drummondville ;
• Section 6 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant à Montréal ;
• Section 7 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant dans trois Directions territoriales de l’OUEST du Québec soit ceux oeuvrant à Rouyn-Noranda, Gatineau, Laval, Saint-Jérôme et Joliette ;
• Section 8 – regroupe l’ensemble des ingénieurs oeuvrant dans trois Directions territoriales de l’OUEST du Québec soit ceux oeuvrant à Sherbrooke,  Saint-Hyacinthe, Boucherville,  Longueuil ,Châteauguay, Saint-Jean-Sur-Richelieu et Ormstown.

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